菩萨不能方卧室吗？
1，首先说明一点，佛教并不主张特别虔诚的信仰者去寺庙里长住。佛教更鼓励大家回到现实社会中，做一个行善的践行者。所以如果题主是想要自己一个人远离尘世的喧嚣、向往那种“云在青山月在天”的清静生活而选择去寺院里的寮房居住是完全可以的（不过要看看这座寺院是否提供这种服务）。但是如果是因为某种“业障”或者内心痛苦不堪而想离开红尘世界，那么我的建议是放下一切前往寺院内（最好能有人陪同），接受佛法的洗礼，用佛法智慧来对治内心的烦恼。但是千万不要以“闭关修行”的名义把自己封闭起来。因为真正的修行在于当下，只要你在修行中能学会把心收回来，时刻作自我观照，那么你随时随地都在修行中。
2，至于楼主提到的能不能在卧室内供佛，这个并没有什么禁忌。只要你觉得这样会让你心安，让你能够保持虔诚的心态，你大可这么做。如果你进了自己的卧室还能有相当程度的自信和虔诚，那当然是最好的了。如果因为进了卧室就丧失了这些，那么说明你的信心还不够强大。这时候你应该做的不是调整供佛的位置，而是应该先调整一下自己内心的状态——多想想佛经的道理并且把这些付诸于实际行动，这比任何外在形式的供养都重要。
3，最后补充一句，其实不论你是否烧香礼佛、供奉食品，佛菩萨都是无量功德、没有丝毫私心的。你对他们好，他们对你同样会很好。他们不依赖你的供养而存在，他们需要的不是你供奉的那一炷香、那一盘水果，而是需要你尽己所能地去实践佛法、自利利他。